B4-BV/BCMP-UE1 : Microbiologie : Bactériologie et Mycologie

L'UE se compose d'une matière enseignée sur une période : Microbiologie P11 (CM, TP) et Microbiologie P12 (CM, TD, TP).

― Bactériologie : Notion d’espèce bactérienne, Phylogénie appliquée aux procaryotes, Identification bactérienne

― Mycologie : Modalités de reproduction, Utilisation des mycètes et de leurs produits, criblage de métabolites secondaires

― Contenu des TPs : Identification bactérienne par des approches biochimiques. Positionnement phylogénétique des souches.

Notions et contenus

― Caractères généraux des procaryotes (structures, diversité métaboliques, diversité du monde procaryote), des mycètes et des organismes fongiformes.

― Notions de Microbiologie : diversités structurale et physiologique, techniques d’études.

― Notions concernant les maladies microbiennes : symptômes, épidémiologie et méthodes de lutte

Compétences

― Maitriser les techniques de base de microbiologie : manipuler en condition d’asepsie
― Utiliser les milieux de culture et les divers supports de culture,
― Observer des échantillons in vitro

― Comprendre la nécessité de la taxonomie bactérienne et fongique comme socle du diagnostic

― Savoir définir une espèce bactérienne et une espèce fongique

― Connaître les éléments théoriques sous-jacents à la comparaison de séquences en phylogénie.

― Recherche de séquences dans les bases de données généralistes et spécialisées.

― Identifier des isolats bactériens et fongiques inconnus par des approches biochimiques et de positionnement phylogénétique.

― Microbiologie de Prescott (DeBoeck), Microbiologie (Dunod),
― Brock Biologie des microorganismes (Brock Biology of Microorganisms)