B2-BCMP/BV-UE4 : Bioinformatique : les domaines OMICS

L'UE se compose d'une matière enseignée sur deux périodes : Bioinformatique : les domaines OMICS P14 (CM, TD) et Bioinformatique : les domaines OMICS P15 (CM,TD)

L’objectif de cet enseignement est de comprendre le principe des méthodes bioinformatiques utilisées pour traiter les données omiques. Les méthodes bioinformatiques abordées sont relatives à 5 grandes thématiques : l’assemblage et l’annotation des génomes (incluant les ontologies), la relation structure-fonction (incluant la recherche de motif), la protéomique, l’étude du microbiote ainsi qu’une introduction aux méthodes de la
métabolomique.
Les notions vues en cours seront complétées par des travaux dirigés en salle informatique où les méthodes vue en cours seront utilisées pour répondre à une question biologique.

Notions et contenus
Bioinformatique P7 et P9

Compétences
Maîtriser le vocabulaire de biologie moléculaire
Connaître les méthodes d’analyse des séquence

― Connaître le principe des méthodes bioinformatiques de traitement des données omiques
― Connaître les limites et avantages des méthodes vues en travaux dirigés
― Savoir utiliser quelques outils de génomiques et de protéomiques avec des illustrations en cancérologie, analyse du microbiote et en génomique végétale.