B3-BCMP/BV-UE1 - Microbiologie : Bactériologie et Mycologie

L'UE se compose d'une matière enseignée sur une période : Microbiologie P11 (CM, TP).

― Bactériologie : Notion d’espèces bactériennes, Phylogénie appliquée aux procaryotes, Identification bactérienne.
― Mycologie : Modalités de reproduction, Utilisation des mycètes et de leurs produits, criblage de métabolites secondaires.
― Contenu des Travaux Pratiques :
Identification bactérienne par des approches biochimiques.
Positionnement phylogénétique des souches.

Notions et contenus
― Caractères généraux des procaryotes (structures, diversités métaboliques, diversité du monde procaryote), des mycètes et des organismes fongiformes.
― Notions de Microbiologie : diversités structurale et physiologique, techniques d’études.
― Notions concernant les maladies microbiennes : symptômes, épidémiologie et méthodes de lutte.
Compétences
― Maitriser les techniques de base de microbiologie : manipuler en condition d’asepsie.
― Utiliser les milieux de culture et les divers supports de culture.
― Observer des échantillons in vitro.

― Comprendre la nécessité de la taxonomie bactérienne et fongique comme socle du diagnostic.
― Savoir définir une espèce bactérienne et une espèce fongique.
― Connaître les éléments théoriques sous-jacents à la comparaison de séquences en phylogénie.
― Recherche de séquences dans les bases de données généralistes et spécialisées.
― Identifier des isolats bactériens et fongiques inconnus par des approches biochimiques et de positionnement phylogénétique. 

― Microbiologie de Prescott (DeBoeck), Microbiologie (Dunod).
― Brock Biologie des microorganismes (Brock Biology of Microorganisms).