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B2-BOP/BCMP/BV-UE1 : Bioinformatique : Programmation

  • Niveau d'étude

    BAC +3 / licence

  • ECTS

    2 crédits

  • Composante

    Faculté des sciences

Description

L'UE se compose d'une matière enseignée sur une période : Bioinformatique P11 (CM, TP) et Bioinformatique P12 (TD).

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Objectifs

Initiation à la programmation en python pour la biologie :
― Les variables, environnement de programmation VScode, les tests, les chaînes (P11)
― Les listes, les boucles et les fonctions (P11)
― Les fichiers : accès aux fichiers locaux ou distants (P12)
― Les expressions rationnelles pour rechercher des motifs dans un texte (P12)

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Pré-requis obligatoires

Compétences
Utilisation des outils ENT & installation logiciel

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Compétences visées

― Savoir écrire des commandes de base en python
― Savoir lire des instructions python et en biopython plus complexes

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Bibliographie

Apprendre à programmer avec python 3, Gérard Swinner, Editions Eyrolles

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Liste des enseignements

  • Bioinformatique